造成系統誤差的來源主要有以下幾點：方法誤差：方法誤差指的是由于食品理化檢驗分析方法本身導致的誤差，這個誤差是不可避免的，因此經常會出現檢驗結果偏低或者偏高的情況。例如在食品理化檢驗中進行重量分析時，沉淀的溶解就容易導致誤差;在滴定過程中沒有反應完全，或者因滴定終點與計量點不相符而導致發生副反應;高溫檢驗導致某些易揮發的物質出現了揮發現象。
儀器誤差：儀器誤差主要是由于儀器不準所導致的，例如儀表刻度盤分度不準確或者零點不準，就會導致檢驗結果偏小或者偏大的情況，這種誤差是一個恒值;電子天平使用時間過長后如果沒有進行校準，則必然會出現稱量誤差;玻璃量器沒有經過質量以及刻度的檢驗，從供應商買來后進行進行使用等均會造成儀器誤差的出現。
試劑誤差：試劑誤差主要是由于試劑不純或者無法達到實驗要求所導致的，例如食品理化檢驗過程中使用的試劑存在雜質，或者蒸餾水、試劑中存在會影響檢驗結果的干擾物，或者由于儲存或者操作環境所導致的試劑變化等均會造成試劑誤差。
食品安全事件的頻頻發生，致使食品安全檢測受到高度重視，國家投入了大量的財力用以購買檢測設備、食品安全檢測機構加班加點工作、科研人員努力研發新型檢測方法、也在兩會中對食品安全檢測提出了建議。這對我國食品的食品安全水平的提高起到了巨大的推動作用，但是在如此頻繁的檢測工作下我國食品安全問題仍然時有出現，究竟是哪些漏洞造成了這一現象的產生?
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